Osis Pniel SMAK 2 BPK Penabur merupakan salah satu organisasi yang dipakai untuk mewadahi dan menyalurkan bakat kepemimpinan (leadership) siswa/i dan memberikan pengalaman berorganisasi di SMAK 2 BPK Penabur. Pniel berarti melihat Allah, sehingga setiap kegiatan yang dilaksanakan difokuskan pada Allah dan hanya mengandalkan kekuatan yang dari Allah.
Organisasi ini dapat menampung ide-ide kreatif siswa yang akan diwujudkan dalam program-program kegiatan Osis. Para pengurus Osis dipilih berdasarkan ketentuan-ketentuan khusus dan diseleksi oleh Wali kelas, Pembina OSIS, Kepala Sekolah dan wakilnya. Para siswa/i yang terpilih akan dikukuhkan dalam pelantikan kepengurusan dengan mengucapkan sumpah jabatan kemudian diberikan pembekalan kepemimpinan (Leadership Training) yang melatih kemampuan memimpin, team work, tanggung jawab dan inisiatif. Pengurus OSIS Pniel memiliki kesempatan untuk merealisasikan ide mulai dari pembuatan proposal kegiatan dan pelaksanaan event-event sekolah yang bersifat dari siswa, oleh siswa dan untuk siswa.